Peserta Didik SMAIT Insan Cendekia Jayapura berasal dari berbagai daerah di wilayah Papua. Diantaranya selain berasal dari daaerah Kabupaten dan Kota Jayapura juga berasal dari kabupaten lain yaitu Wamena, Nabire, Biak, Sarmi, Keerom, dan lain-lain.
Adapun Rinciannya sebagai berikut :
Kelas X
| KELAS | PUTRA | PUTRI | JUMLAH |
|---|---|---|---|
| KELAS X | 28 | 18 | 46 |
| KELAS XI | 8 | 9 | 17 |
| KELAS XII | 8 | 10 | 18 |
| TOTAL | 44 | 37 | 81 |